Doctor Prisoner centra-se em torno de um médico no centro de atendimento de emergência de um hospital universitário, um profissional capacitado que trata seus pacientes com total dedicação e sem discriminação. No entanto, sua licença médica é suspensa como resultado de um incidente de negligência médica que surge quando o diretor da diretoria do hospital causa tumulto. Ele então obtém seu certificado como médico interno e se candidata a trabalhar em uma prisão, onde seu plano é acomodar todas as pessoas importantes - magnatas de negócios, celebridades presas por drogas, estrelas do esporte culpadas de jogos de azar - e ganhar aliados, com o objetivo final de se vingar do hospital que o derrubou. Para fazer isso, ele vai se livrar do médico chefe da prisão e reivindicar o lugar para si mesmo.